マイクロバブルの洗浄力は非常に小さい気泡（マイクロバブル）がゆっくりと上昇することにより周りの汚れを吸着します。しかも、マイクロバブルは、マイナスの電気を帯びていて、汚れ（プラス電気と結びつき、汚れを接がすように落とし、汚れを水面まで浮かせます。マイクロバブルが汚れを一度キャッチするとその汚れをしっかりキープをするので汚れをもちろんマイクロバブルの気泡の大きさは、直径わずか1/100mm以下と小さいので、毛穴などの中まで入り込んで汚れを落とすので非常に高い洗浄力があるといわれています。
NHKのサイエンスZEROでも紹介をされていますが、海からあげてきたカキを水槽にいれて24時間おき、体内の汚れを取り除き食中毒の原因となる細菌を殺菌します。この水槽にマイクロバブルを発生させて3時間おいておくと、カキ体内にマイクロバブルの微細な泡が取り込まれ内部の汚れ砂や取り除き、マイクロバブルを使用していないカキに比べると身が白くなります。この水槽には殺菌効果の高いオゾンガスも注入されています。
マイクロバブルを利用した洗浄装置で、油が付着したドーナツ形のステンレス製部品を洗浄したところ、目視や油の除去した量より洗浄剤などを使用しないで金属部品の脱脂が可能であることが分かりました。
また、マイクロバブル洗浄には、洗浄する対象物の形状や汚れの量に対して最適なマイクロバブルの量やその性質が必要であることも確認しました。さらに、マイクロバブル発生器の吐出圧力を高くすると、洗浄効果が大きくなりました。